イオン結合：原子（官能基）の性質により、電子を失った陽イオンと、
余分に電子を獲得した陰イオンの間の作用。
水素結合：窒素や酸素は電子を引く作用が強く、Ｎ−ＨやＯ−Ｈ
の結合では、水素が部分的にプラスの電荷を帯びている。
このＨと別の分子（原子団）内のＮやＯ（部分的にマイナスの電荷を帯びている）との間で引き合いが生じる。
Ｎ−Ｈ・・・Ｎ
Ｎ−Ｈ・・・Ｏ
Ｏ−Ｈ・・・Ｎ
Ｏ−Ｈ・・・Ｏ
これらの例で、左側のＮ、Ｏは水素供与対、右側のＮ、Ｏは水素受容体と呼ばれる。
ファン・デル・ワールス力：原子核を取り巻く電子の密度は常に変化していて
電子密度の片寄りに基づいて、原子間に引き合う力が生じる。
電子雲どうしが重なるほど原子が近づくと、逆に強い反発が生じる。
この限界の距離をファン・デル・ワールス半径と呼ぶ。
コンフォメーション：単結合のまわりの自由回転により、
分子は様々な形をとりうる。この形の違いをコンフォメーションと呼ぶ。
蛋白質がとりうるコンフォメーションは少数（普通２つ）に限定されていて、
それぞれが蛋白質の働きの上での特定の状態に対応する。
例：活性型／不活性型、
基質結合型／基質非結合型